苦楝丛枝植原体质粒的测定与分子特征
[目的]测定苦楝丛枝植原体(CWB植原体)质粒并分析其分子特征.[方法]扩增苦楝丛枝植原体质粒片段并进行系统进化分析,预测质粒编码蛋白的跨膜区、亚细胞定位；以质粒pCWBFq repA为模板制备探针,利用Southern blot方法检测苦楝丛枝植原体及其他几种植原体的质粒.[结果]测定了苦楝丛枝植原体福清株系的一个质粒pCWBFq,该质粒全长4446 bp,A+T含量为73.5％,编码6个蛋白,其中pCWBFq P2-P5五个编码蛋白分别含有3、2、1和2个跨膜区,其信号肽(Singnal Peptide,SP)信号值分别为0.989、0.505、0.918和0.914.氨基酸序列相似性比较表明:pCWBFq RepA蛋白与其他植原体质粒RepA的同源性在9.6％ - 85.6％之间,而pCWBFq SSB蛋白与其他植原体质粒SSB的同源性在74.0％ - 89.4％之间.用pCWBFq repA探针检测到苦楝丛枝植原体中质粒的存在,同时也能够检测到16SrI组的泡桐丛枝植原体(PaWBNy),海南长春花绿变植原体(PeVHn),苦楝丛枝植原体福州株系(CWBFz)和桑树萎缩植原体濮阳株系(M DPy)中的质粒,但16SrV组的枣疯植原体北京株系(JWBBj)、樱桃致死黄化西昌株系(CLYXc)和重阳木丛枝南昌株系(BiWBNc)中未能检测到任何杂交信号.[结论]苦楝丛枝植原体质粒pCWBFq编码的6个蛋白中,除与质粒复制有关的RepA和SSB外,另外4个均为含有疏水结构的分泌蛋白或膜蛋白.植原体质粒的同源基因间存在程度不同的变异,其中repA基因在所有植原体质粒上均存在,但变异性相对较大,而ssb基因仅存在于16SrI组植原体质粒中,且变异相对较小.16SrI组的CWBFq、PaWBNy、PeVHn、CWBFz和MDPy中均存在数量和大小不同的质粒,而16SrV组的JWBBj、CLYXc和BiWBNc中或含有的质粒因与pCWBFq repA探针的同源性较低而不能被检测到.
苦楝丛枝植原体、质粒、序列分析、系统进化、DNA杂交
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Q939(微生物学)
质检公益性行业科研专项200810517;国家自然科学基金30872025
2011-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
1158-1167
