应用16S rRNA基因技术研究仔猪结肠梭菌Ⅳ群变化
[目的]研究从7日龄到35日龄(断奶后两周)仔猪结肠中梭菌Ⅳ群(柔嫩梭菌群,Clostridium Leptum group)结构以及数量的变化,探究该菌群与结肠中丁酸浓度的关系.[方法]选取3窝新生仔猪,分别在7、14、21(断奶)、24和35日龄每窝随机屠宰1头,收集结肠内容物,利用气相色谱测定挥发性脂肪酸(Volatile fatty acid,VFA);提取结肠内容物总细菌DNA,利用基于16S rRNA基因的变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)和Real-time PCR技术定性、定量分析梭菌Ⅳ群.[结果]对仔猪结肠中梭菌Ⅳ群DGGE图谱进行相似性分析显示,7日龄仔猪样品归于一簇,数值达90%以上,而与其他日龄的样品间相似性较低,断奶前(21日龄)和断奶后3天菌群则没有显著变化.Real-time PCR定量分析显示,仔猪结肠总细菌拷贝数在断奶后3天显著降低,这一趋势与结肠中的总挥发性脂肪酸和丁酸浓度变化相似,而梭菌Ⅳ群拷贝数变化则不显著.克隆和测序分析表明,仔猪结肠梭菌Ⅳ群中的优势菌为Faecalibacterium prausnitzii,Subdoligranulum variabile以及一些未培养细菌.[结论]7日龄至14日龄仔猪结肠中梭菌Ⅳ群发生改变,但断奶对其影响不大;该菌群和结肠丁酸浓度关系还需进一步研究.
16S rRNA 基因、变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis、DGGE)、仔猪、梭菌Ⅳ群
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S811.6(普通畜牧学)
国家自然科学基金青年基金30901036;南京农业大学青年科技创新项目
2010-12-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
1373-1379
