细菌外毒素序列中特有模体的识别及其基因本体注释分析

摘要：

[目的]识别细菌外毒素序列中特有模体,进一步理解外毒素的致病机制.[方法]构建非致病性细菌蛋白质数据库,利用InterProScan对数据库中非致病菌蛋白质序列以及收集的经实验确认的89条细菌外毒素蛋白质序列进行模体搜索.[结果]在89条细菌外毒素序列中,分析得到了39个细菌外毒素特有模体.[结论]得到的外毒素特有模体与外毒素功能密切相关,为在致病性细菌基因组内搜索外毒素序列奠定了基础;同时通过对外毒素特有模体的基因本体(Gene ontology,GO)注释分析,进一步阐明了细菌外毒素的致病机制.

关键词：外毒素、模体、基因本体

所属期刊栏目：50

分类号：Q933(微生物学)

在线出版日期：2010-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1246-1250