溶藻弧菌质粒pVAE259全序列测定与分子生物学特征分析

摘要：

[目的]获得溶藻弧菌环状质粒pVAE259全序列,分析其分子生物学特征并探索该质粒可能具备的功能.[方法]使用酶切、克隆测序的方法获得pVAE259的全序列,利用软件分析DNA序列和可能的编码蛋白,推测质粒的生物学信息.[结果]pVAE259为闭合环状质粒,全长6,075 bp,GC含量为42.16%.在NCBI中比对发现pVAE259与Vibrio sp.41隐蔽性质粒pPS41具有较高的相似性.我们在序列中找到一个oriT位点,另外全序列的4118-5494 bp推测为质粒复制区域.pVAE259中存在7个氨基酸序列长度大于100的开放式阅读框(ORF):ORF1-ORF7.其中ORF1编码蛋白属于释放酶超级家族(Relaxase Super-family)蛋白,在NCBI数据库中它与大肠杆菌(Escherichia coli)的MobA-like蛋白最相似;ORF2编码蛋白属于复制酶超级家族(Replicase Super-family),它与嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)的复制蛋白RepA最相似;ORF5与伸长盐单胞菌(Halomonas elongata)质粒pHE1的转移蛋白MobC相似.[结论]根据上述结果及相关文献分析,pVAE259可能是具有转移能力的质粒,该质粒是否影响宿主菌的表型性状还不清楚.

关键词：溶藻弧菌、质粒、复制区域、开放性阅读框

所属期刊栏目：50

分类号：Q938(微生物学)

资助基金：科技部科研项目2006CB101803;国家自然科学基金30700016

在线出版日期：2010-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：162-168