华癸中生根瘤菌质粒复制基因repC的克隆与鉴定

摘要：

[目的]repC为质粒复制必需的起始蛋白基因.本研究旨在对华癸中生根瘤菌菌株HN3015及其质粒消除突变株进行repC基因的克隆和鉴定.[方法]采用通用引物RC1和RC3进行repC基因的PCR扩增,扩增产物克隆到载体pMD-18T,然后测序.利用Southern杂交对repC基因定位.利用在线软件分析基因的序列特征,BLAST工具进行同源性搜索;ExPASy推断其氨基酸的序列;ChstalW进行同源核苷酸和氨基酸序列的多重比较分析;PredictProtein进行蛋白二级结构分析.[结果]供试菌株均扩出了750 bp左右的repC序列.Southern杂交结果显示:repC基因在每个供试菌株中只存在于一个质粒上.[结论]生物信息学分析结果表明:供试华癸中生根瘤菌菌株的repC序列相似性高达100%,但与其它根瘤菌的repC基因有明显差异.本研究对深入阐明华癸中生根瘤菌质粒复制机制具有一定参考价值.

关键词：华癸中生根瘤菌、repC、PCR扩增、鉴定

所属期刊栏目：49

分类号：Q933(微生物学)

资助基金：湖北省自然科学基金2007ABA316;湖北省教育厅科学技术研究计划D20081509

在线出版日期：2010-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1465-1469