羊轮状病毒NT株VP1基因的测序和分子进化分析

摘要：

[目的]为了研究羊轮状病毒NT株VP1基因的遗传进化规律,[方法]根据CenBank中相关VP1基因的保守序列,设计合成引物,扩增NT株VP1基因并进行克隆测序和序列分析.[结果]氨基酸序列比较表明NT株与其他毒株VP1基因的相似性为77.3%-98.4%,且氨基酸突变多发生在VP1蛋白的非功能区.VP1蛋白进化树表明NT株与牛轮状病毒处于同一进化分支,有较近的亲缘关系.结合26株具有代表性的轮状病毒,计算毒株间VP1基因的核苷酸和氨基酸进化距离,并对核苷酸的同义突变率(dS)和非同义突变率(dN)进行研究,发现dN/dS的比值小于1,说明同义替代是VP1基因在进化过程中的主要变异.[结论]本文首次对羊轮状病毒NT株进行了VP1基因的测序,并对VP1基因的进化距离和进化规律进行深入探讨.

关键词：羊轮状病毒NT株、VP1基因、序列联配、进化距离

所属期刊栏目：49

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

在线出版日期：2009-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1055-1062