应用rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术对山羊瘤胃细菌多样性的研究

摘要：

采用免培养的rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)对3种山羊(波尔山羊,内蒙古绒山羊,四川南江黄羊)瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析.研究结果显示 rpo B DGGE图谱中条带数目少于16S rDNA图谱,并且条带分离效果明显,更有利于分析瘤胃细菌群落组成.从两种DGGE图谱中均可以发现3种山羊瘤胃细菌具有一定的相似性,种内个体间相似性明显高于种间相似性,这说明寄主品种是影响瘤胃细菌种群构成的一个重要因素.同时进行了部分优势细菌16S rDNA基因V6-V8区序列的系统发育分析.基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有4条克隆的序列与基因库最相似菌的相似性大于97%,余下的克隆序列相似性在89%～96%之间,其中13条序列的与之相似性最高的序列均来自于未被鉴定的瘤胃细菌.

关键词：DGGE、16S rDNA基因、编码RNA聚合酶β亚基(rpoB)基因、瘤胃细菌、遗传多样性

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分类号：Q93(微生物学)

资助基金：国际科技合作项目2004DFA06800;中央级科研院所社会公益研究专项基金2005DIB4J038

在线出版日期：2007-04-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：285-289