大肠杆菌mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性的关系

摘要：

从GenBank获得大肠杆菌K-12 MG1655株的全基因组序列,计算了与基因密码子偏好性相关的多个参数(Nc、CAI、GC、GC3s),对其mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性之间的关系进行了统计学分析,发现虽然翻译效率(包括翻译速度和翻译精度)是制约大肠杆菌高表达基因的密码子偏好性的主要因素,同时,mRNA编码区长度及其形成二级结构的倾向也是形成这种偏好性的不可忽略的原因,而且对偏好性有一定程度的削弱.另外对mRNA编码区形成二级结构倾向的生物学意义进行了讨论分析.

关键词：大肠杆菌、密码子偏好性、mRNA编码区、mRNA二级结构、翻译效率

所属期刊栏目：46

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金90208018;90303018;国家自然科学基金A0324101

在线出版日期：2006-12-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：895-899