基于PCR-DGGE指纹的南海海绵共附生细菌优势种群的揭示与系统发育分析

摘要：

采用PCR-DGGE指纹、克隆测序和系统发育分析技术较系统地对我国南海贪婪倔海绵(Dysidea avara) 和澳大利亚厚皮海绵(Craniella australiensis)共附生的优势细菌进行了研究.研究发现变形菌门(Proteobacteria)细菌是这两种海绵中的主要优势细菌,贪婪倔海绵中的变形菌包含了α、β、γ三种类型,而澳大利亚厚皮海绵中仅有γ一种类型.两种海绵都有拟杆菌(Bacteroidetes),但是具体的种类不同.这些细菌都是第一次在海绵中被发现.澳大利亚厚皮海绵共附生的优势细菌还包括放线菌属(Actinobacterium)及厚壁菌门(Firmicutes)细菌,菌群多样性要比贪婪倔海绵的丰富.两种海绵尽管来自于同一海域但其共附生优势细菌的组成明显不同,这说明海绵共附生微生物具有宿主特异性.

关键词：海绵共附生细菌、16SrDNA、PCR-DGGE指纹、系统发育分析

所属期刊栏目：46

分类号：Q93(微生物学)

资助基金：国家科技攻关项目2002AA628080,2004AA628060;上海市青年科技启明星计划04QMX1411

在线出版日期：2006-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：487-491