家蚕浓核病毒DNV-3(中国株)的VD2基因组序列分析

摘要：

浓核病毒BmDNV-3(中国株)基因组中含有两种不同的单链线形DNA 分子(VD1,VD2).该病毒的VD2被分离、纯化、克隆到pUC119载体上,并完成了VD2全基因组序列的测定.序列分析显示:VD2全基因组长为6022个核苷酸,末端拥有524个核苷酸反向重复序列(ITRs).VD2基因组正链含有2个大的开放阅读框,负链含有1个小的开放阅读框.计算机分析推测该基因组正链上开放阅读框(ORF1) 及负链上开放阅读框(ORF3)主要编码病毒的非结构蛋白,而正链上开放阅读框(ORF2)主要编码病毒的结构蛋白.比较BmDNV-3 VD2和BmDNV-2 (Yamanashi isolate) VD2基因组全序列,两者同源性达97.7%,并且有132个碱基的替代、11个碱基的删除和2个碱基插入.研究结果显示BmDNV-3 VD2和BmDNV-2 VD2有很近的亲缘关系,但也发生一定的变异,这为更好地理解浓核病毒种类的多样性,也为研究家蚕浓核病毒进化提供了有益的线索.

关键词：家蚕浓核病毒、序列分析、基因组结构

所属期刊栏目：46

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：江苏大学校科研和教改项目1291180009;江苏省教育厅高校自然科学基金03KJD180065

在线出版日期：2006-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：363-367