北极太平洋扇区海洋沉积物细菌多样性的系统发育分析

摘要：

对北极太平洋扇区3个不同深度的海洋沉积物样品,采用PCR结合变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术进行细菌16SrRNA基因V3区序列的系统发育分析.结果表明,同一个沉积物样品不同层次的DGGE电泳图谱不完全相同.从3个沉积物样品中共获得50条序列,大部分序列与从海洋环境尤其海洋沉积物获得的细菌16S rDNA序列相似性较高(88%～100%),归属于变形细菌(Proteobacteria)的gamma亚群、alpha亚群、beta亚群、epsilon亚群、delta亚群,Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides(CFB)群细菌和高G+C含量的革兰氏阳性细菌等系统分类群,其中变形细菌(Proteobacteria)的gamma亚群为沉积物中的优势细菌类群.

关键词：北极太平洋扇区、沉积物、细菌、系统发育

所属期刊栏目：46

分类号：Q938;Q939(微生物学)

资助基金：科技部科研项目2004CB719601;中国极地研究中心极地科学青年创新项目JDQ200401;科技部"攀登计划"2003DEB5J057

在线出版日期：2006-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：177-183