大肠杆菌和志贺氏菌O-抗原糖基转移酶与聚合酶的生物信息学研究

摘要：

利用生物信息学手段对大肠杆菌和志贺氏菌的110个O-抗原糖基转移酶与39个O-抗原聚合酶的序列进行分析,探讨这两种酶的序列和结构特点.统计了其序列一致性,密码子使用和(G+C)%含量的特点;讨论了O-抗原糖基转移酶和聚合酶对底物的特异性;推测了6组糖基转移酶的功能;通过对蛋白拓扑结构的预测,发现O-抗原聚合酶中广泛存在一个位于细胞周质中的亲水环(Loop),是可能的功能区域;通过对蛋白高级结构的预测,发现O-抗原糖基转移酶属于两个不同的蛋白超家族.

关键词：大肠杆菌、志贺氏菌、O-抗原、糖基转移酶、聚合酶、生物信息学

所属期刊栏目：44

分类号：Q93(微生物学)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2002AA2Z2051;国家自然科学基金30125001

在线出版日期：2004-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：345-350