3株杂色鲍致病菌--副溶血弧菌的16S-23S rDNA间区序列的分析

摘要：

以细菌的16S rDNA 3′端和23S rDNA 5′端的高度保守区为引物,扩增了3株杂色鲍致病菌-副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)的16S-23S rDNA 间区,克隆到pGEM-T载体上,测序.用BLAST和 DNAstar软件对16S-23S rDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析.结果表明副溶血弧菌ZSU008和ZSU009测出的16S-23S rDNA 间区均有6条,间区类型也相同,分别为IGSGLAV、IGSGLV、IGSAG、IGSIA、IGSG和IGS0.其中IGSGLAV最大,包含tRNAGlu、tRNALys、tRNAAla和tRNAVal基因;IGSGLV包含tRNAGlu、tRNALys和tRNAVal基因;IGSAG包含tRNAAla和tRNAGlu基因;IGSIA,则为tRNAIle和tRNAAla基因;IGSG仅包含tRNAGlu基因;而IGS0最小,未包含任何tRNA.菌株ZSU010测出的16S-23S rDNA IGS序列有5条,除缺少IGSAG外,其余的IGS类型均与ZSU008和ZSU009相同.与GenBank 内的副溶血弧菌IGS序列比较,发现副溶血弧菌所有类型的IGS的tRNA基因两端的非编码区具有较高的种内同源性.16S-23S rDNA 间区结构的差异为建立一种新的副溶血弧菌检测方法奠定了基础.

关键词：副溶血弧菌、16S-23S rDNA间区、tRNA基因

所属期刊栏目：44

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2001AA622020;广东省科技厅科研项目2KB05301N

在线出版日期：2004-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：304-308