内禀无序蛋白构象与带电氨基酸残基排布关系——以精氨酸和天冬氨酸组成的随机多肽为例

摘要：

内禀无序蛋白的结构特征与其氨基酸序列有着密切的联系.其中一个核心问题是正负带电氨基酸残基的排列如何影响无序蛋白或者多肽的构象?为了回答这一问题,本研究以天冬氨酸和精氨酸两种带电残基组成的随机多肽为研究对象,利用全原子蒙特卡罗模拟和温度副本交换采样方法,研究了随机多肽的电荷排布与结构之间的定性关系.结果表明:正负带电残基在序列上混合均匀时,由于肽链内部的静电吸引和排斥相互抵消,肽链倾向于形成无规卷曲的构象;正负带电残基分离时,由于长程静电相互吸引,多肽倾向于形成类β-发卡的形状.

关键词：内禀无序蛋白、构象、序列、分子模拟

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资助基金：国家重点基础研究发展计划2013CB834100;国家自然科学基金11334004, 11174133, 81421091, 11774157;2017年国家级大学生创新创业训练计划201710929002;湖北医药学院研究生启动金批准号:2011QDZR-11 资助的课题.Project supported by the National Basic Research Program of ChinaGrant 2013CB834100;the National Natural Science Foundation of ChinaGrant . 11334004, 11174133, 81421091, 11774157;the 2017 National Training Program of Innovation and Entrepreneurship for Undergraduates, ChinaGrant 201710929002;the Initial Project for Post-Graduates of Hubei University of Medicine, ChinaGrant 2011QDZR-11

在线出版日期：2018-03-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：292-300