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10.3866/PKU.WHXB201612052

禽流感病毒HA蛋白与人受体的分子对接

引用
血凝素(hemagglutinin,HA)是位于禽流感病毒表面的糖蛋白.在病毒感染过程中,HA与禽类宿主细胞表面受体结合,介导病毒膜与宿主核内体膜的融合,在传染过程中发挥关键作用.自然界中的禽流感病毒处于不断演化之中,其HA的禽受体结合位点常常发生氨基酸变异.因此,当HA变异体与人受体结合能力较强时,禽流感病毒往往会发生跨种传播而感染人.为预防禽流感的跨种传播,人们迫切需要发展大规模快速检测或预测HA变异体与人受体结合亲和力的方法,以评估各种新发禽流感病毒的跨种传播能力,提前筛选出有潜在危险的病毒株.针对此问题,本研究以H7N9亚型的HA蛋白H7为研究对象,发展了一种运用分子对接的计算方法,预测HA变异体与人受体的结合亲和力.该方法的计算结果表明,H7与人受体的结合亲和力普遍弱于有较强传染人能力的H1,说明H7N9亚型病毒的跨种传播能力普遍较弱;但是,计算分析也揭示,部分新发的H7N9毒株的HA有强的人受体结合亲和力,提示在自然演化过程中,H7N9病毒有可能演化出具有较强的感染人能力的新毒株,这与2013年禽流感疫情的实际发生情况相一致.因此,本文所发展的计算方法可用于快速预测新发禽流感病毒HA与人受体的结合亲和力,为新发禽流感病毒的跨种传播风险评估提供理论依据.

禽流感病毒、跨种传播、受体结合特异性、分子对接、结合自由能

33

O641(物理化学(理论化学)、化学物理学)

The project was supported by the National Natural Science Foundation of China91430112,31671386;Special Program for Applied Research on Super Computation of the NSFC-Guangdong Joint Fund;China.国家自然科学基金91430112,31671386;NSFC-广东联合基金第二期超级计算科学应用研究专项和国家超级计算广州中心支持资助项目

2017-04-17(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共9页

633-641

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