ω-芋螺毒素的定量构效关系与虚拟筛选

摘要：

ω-芋螺毒素属于海洋生物活性多肽，由24-31个氨基酸残基组成.特异性作用于电压敏感的钙离子通道(VGCCs)，能够直接开发成药物或作为先导化合物进行新药开发.本文应用新型氨基酸残基结构描述符c-scales和遗传偏最小二乘算法，对ω-芋螺毒素进行定量构效关系(QSAR)研究，并设计、构建了容量为2244个化合物的N-型和P/Q-型VGCC拮抗剂虚拟组合多肽库，然后分别采用QSAR模型预测和相似性搜索方法对组合多肽库进行了虚拟筛选.研究结果表明，建立的N-型和P/Q-型VGCC拮抗剂QSAR模型均具有较好的预测能力，交叉验证相关系数(CV-r2)均大于0.89.主成分分析和聚类分析结果表明，虚拟组合多肽库中化合物具有较好的结构多样性和差异性.通过虚拟筛选，得到了具有高预测活性的6个N-型和19个P/Q-型钙离子通道拮抗剂，为进一步的合成和活性评价奠定了理论基础.同时，本文建立的多肽QSAR预测模型和虚拟筛选策略，为其它多肽类化合物的定量构效关系研究和虚拟筛选提供了参考.

关键词：ω-芋螺毒素、钙离子通道拮抗剂、QSAR、虚拟筛选

分类号：O641(物理化学（理论化学）、化学物理学)

在线出版日期：2014-12-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：2157-2167