MOLMAP指数及其在变异性预测中的应用
分子映射(MOLMAP)指数是以分子的化学键描述符为基础,通过Kohonen自组织映射依据一定的算法而衍生.化学键描述符是由化学键的物理化学性质,如两端原子的电荷差和拓扑性质,键连杂原子数量等所组成.本文将分子映射指数应用于4075个有机物质(Ames实验结果:2305个结构有诱变性,1770个结构无诱变性)的变异性预测.通过随机森林,分别采用三种类型的指数建立模型:(1)采用不同维数的分子映射指数;(2)采用全局分子描述符;(3)将分子映射指数与全局分子描述符相结合.整个数据集的集外(out-of-bag)交叉验证的正确预测率达到85.4％.为了检验模型的稳定性,采用所建模型预测源于另一数据库的472个化合物,正确预测率为86.7％,与此前的研究相比,两个预测结果均有所提高.
分子映射指数、Kohonen自组织映射、随机森林、诱变性、结构-活性关系
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O641(物理化学（理论化学）、化学物理学)
国家自然科学基金20875022;教育部留学回国人员科研启动基金20091001;河南省国际科技合作项目114300510009
2012-05-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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