紫杉醚与αβ微管蛋白的分子对接

摘要：

采用Insight IUAffinity对紫杉醚与αβ微管蛋白进行分子对接,共得到10个对接构象.应用密度泛函B3LYP/6-31G方法计算对接口袋构象的结合能,筛选出结合能达-190.53 kJ·mol-1的最优对接构象5.通过构象分析建立紫杉醚与受体结合的作用模型,结果表明,在活性口袋的底部紫杉醚与受体间的作用主要是疏水作用,而在活性口袋的顶部两者间主要是氢键作用.氢键作用位置可分为A和B两个作用区,其中A区有3个氢键.由C13侧链分别与受体的ASP26和ARG369作用形成;B区也有3个氢键,是由紫杉醚母环上的极性基团分别与受体的THR276、ARG278和GLN282作用产生的.紫杉醚与αβ微管蛋白间形成的6个氢键可以有效地将紫杉醚固定在活性口袋中.

关键词：紫杉醚、αβ微管蛋白、分子对接

所属期刊栏目：24

分类号：O641(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：广东省自然科学基金5005938;广东省教育部产学研结合专项资金2007A09030246

在线出版日期：2008-12-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1839-1844