热休克蛋白A4在肺腺癌中的表达及其临床意义

摘要：

目的 以生物信息学方法研究热休克蛋白A4(HSPA4)在肺腺癌中的表达及其临床意义.方法 下载TCGA和GEO数据资料,R软件分析HSPA4基因在肺腺癌和癌旁组织中的表达差异和临床分期的相关性;以HPA数据库资料比较肺腺癌与正常肺组织蛋白表达差异;通过ROC曲线、时间依赖性ROC曲线、列线图、相关性分析HSPA4表达在肺腺癌中的诊断、预后价值和肿瘤微环境中与各种免疫细胞的相关性.应用STRING数据库建立HSPA4相关蛋白互作网络,并利用GO、KEGG及GSEA数据库分析HSPA4及其互作蛋白在肺腺癌中的潜在功能.结果 在TCGA-LUAD、GSE43448和GSE10072数据集中,HSPA4在肺腺癌中mRNA较正常肺组织表达升高(P<0.001),在蛋白水平表达也明显升高.HSPA4高表达与肺腺癌的TNM分期和病理分期相关;ROC曲线显示HSPA4具有良好的诊断价值(AUC=0.810).时间依赖性ROC曲线显示1、3、5年AUC分别为0.605、0.583和0.553.列线图显示HSPA4与其他临床因素共同具有较好的1、3、5年生存率预测价值.K-M图显示HSPA4高表达与肺腺癌患者的不良预后有关.HSPA4基因改变率为2.2％,3个甲基化位点与肺腺癌的预后相关.在肿瘤微环境中,HSPA4表达与辅助T细胞、辅助T细胞2等免疫细胞正相关;与B细胞、浆细胞样树突状细胞、CD8 T细胞、细胞毒性细胞、CD56较高表达自然杀伤细胞、T细胞等免疫细胞呈负相关.PPI蛋白互作显示HSPA4与HSP90AA1、SNCA等蛋白相互作用,GO、KEGG、GSEA通路富集分析显示HSPA4具有参与抗原加工提呈、调节免疫等功能.结论 HSPA4在肺腺癌中高表达,且其表达水平与肺腺癌患者总体预后相关,同时参与了肿瘤的发生和发展,并影响了肿瘤微环境,可能成为肺腺癌中新的生物标记物和治疗靶点之一.

关键词：热休克蛋白、肺腺癌、热休克蛋白A4、生物信息学

所属期刊栏目：34

分类号：R734.2(肿瘤学)

在线出版日期：2023-03-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：97-103