基于向量空间模型的基因序列聚类及仿真实验

摘要：

聚类算法广泛应用于生物信息学教据分析中,是基因序列和表达数据分析研究的主要技术之一.提出了一种基于向量空间模型的基因序列聚类分析算法.首先利用DNA序列的结构特征,将多个DNA序列构成序列集.结合向量空间模型算法,计算DNA序列集中两两序列之间的相似度矩阵,并选取适当的阈值对相似度矩阵作截集处理,从而得到最终的聚类结果.基于DNA序列数据的仿真实验结果表明,该算法在基因序列的分析中是实用、有效的,并且具有算法简明、语义准确、向量维数可控等优点.

关键词：基因序列、向量空间模型、聚类分析

所属期刊栏目：26

分类号：TP18(自动化基础理论)

在线出版日期：2014-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：155-157