基于弱监督的蛋白质交互识别

摘要：

蛋白质交互信息是解决大量医学难题的关键信息,这些信息都记录在医学文献中,随着生物医学文献的大量增加,以手工收集信息的方式已经难以满足实际需求.对此,提出一种基于弱监督的方法识别文本中的蛋白质交互关系.该方法首先根据文本库产生蛋白质交互的向量表示;接着根据蛋白质对实例的相似性对实例聚类,产生提取模式;然后根据提取模式从文本库中找到新的满足条件的蛋白质对实例,作为候选实例;最后对候选实例对应的蛋白质对进行评估,并将满足条件的蛋白质对添加到种子集合中.该方法仅需少量的蛋白质对作为种子,通过迭代算法不断扩充种子集,可以使得监督最小化,极大地减少了人工干预.实验结果表明,该方法取得了较高的精度和召回率.

关键词：蛋白质交互、弱监督、聚类、模式

所属期刊栏目：28

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金61202132

在线出版日期：2018-03-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：19-23