一种对预测Motifs算法的评价策略

摘要：

主要研究了如何评价蛋白质家族Motifs预测算法的预测结果,目的是在对传统的算法预测问题分析优化的基础上,制定新的评价策略.主要方法是通过对MEME算法和PKG算法预测结果的比较分析,计算同一家族中Motifs的敏感性和特异性并比较它们对应的ROC曲线,确定真实的Motifs,进而获得该蛋白质家族的最佳Motifs的模型.实验结果表明这种评价策略可用于算法对蛋白质家族Motifs预测结果的评价,还可利用确定的最佳Motifs搜索数据库来预测蛋白质家族中其他的Motifs.

关键词：Motifs预测、算法比较、评价策略

所属期刊栏目：21

分类号：TP181(自动化基础理论)

资助基金：国家自然科学基金60801047

在线出版日期：2012-02-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：171-175