10.3969/j.issn.1673-629X.2008.10.037
基于支持向量机的蛋白质相互作用位点预测
蛋白质的功能常体现在生物大分子的相互作用中,识别蛋白质相互作用位点对于研究蛋白质功能发挥着重要作用.蛋白质问主要通过表面残基发生相互作用,蛋白质相互作用形成复合体时,只有部分表面残基参与了该过程.基于序列谱信息,提取序列上相邻残基的序列谱作为输入特征向量,对大小为3和7的残基信息窗(win3,win7),分别采用支持向量机(SVM)分类器对蛋白质相互作用位点进行预测、比较和分析.最终实验结果为:win3的平均正确率为69.31%,win7的平均正确率为69.68%.
蛋白质相互作用、序列谱、残基信息窗、支持向量机
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TP183(自动化基础理论)
安徽省自然科学基金KJ20078239;安徽建筑工业学院青年科研基金200510304;安徽省高校青年教师科研资助计划2007jql140
2008-11-27(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共4页
127-129,132