基于茶蛋白质组学数据分析植物亚细胞定位预测软件的应用

摘要：

以500个茶(Camellia sinensis(L.)O.Ktze.)叶片的蛋白质作为数据集,比较TargetP、WoLF PSORT、LocTree和Plant-mPLoc 4种软件预测亚细胞定位的可信度和灵敏度.结果显示,4种软件预测可信度均高于80％,依次排序为TargetP>LocTree>WoLF PSORT>Plant-mPLoc.其中,LocTree对细胞质蛋白和分泌蛋白检测灵敏度最高,但对叶绿体蛋白灵敏度最低;Plant-mPLoc检测核蛋白最灵敏,但对细胞质蛋白最不敏感;TargetP检测叶绿体蛋白最灵敏,但仅能区分3个亚细胞器官;WoLF PSORT对分泌蛋白检测灵敏度最低,但对其他蛋白均较灵敏.基于上述结果,该研究针对4种软件提出了合理的使用建议.

关键词：茶、蛋白质、亚细胞定位、预测

所属期刊栏目：38

分类号：Q943.2(植物学)

资助基金：湖北省自然科学基金项目2019CFB600

在线出版日期：2020-11-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：671-677