蕨类植物psbD基因的适应性进化和共进化分析
D2蛋白是植物光系统Ⅱ复合体(PSⅡ)核心蛋白之一,由叶绿体psbD基因编码.为了深入理解核心薄囊蕨类植物在阴生环境下的“辐射”式演化,我们对12种蕨类植物的psbD基因进行了克隆和测序,然后联合已公布的其他8种蕨类植物的psbD序列,基于ω值(非同义替换率dN和同义替换率ds的比值)探讨了该基因经受的选择压力.发现D2蛋白在大多数分支和位点受到强烈的负选择,但是树蕨类分支的psbD进化速率低且ω值较高.借助多种模型进行的共进化分析显示,树蕨类D2蛋白的168R、245H和272M两两组成具有共进化关系的氨基酸位点对.
核心薄囊蕨、psbD基因、选择压力、共进化
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Q941(植物学)
国家自然科学基金资助项目31070594;湿地演化与生态恢复湖北省重点实验室开放课题
2013-12-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共10页
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