MrBayes（MC）~3GPU算法的优化

摘要：

为了进一步提高CPU-GPU协同贝叶斯种系发生算法n（MC）3的并发度,本文在n（MC）3算法基础上提出了优化算法,修改算法并行策略,重组计算次序,削弱相邻计算节点之间的依赖关系,增强GPU空闲单元的利用,实现了更高的加速比,显著提高了算法性能.

关键词：种系发生、贝叶斯、CUDA、流、并发度

所属期刊栏目：58

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金60903028,61070014资助项目,天津市科技支撑计划重点项目11ZCKFGX01100

在线出版日期：2012-06-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：157-164