基于几何不变量的蛋白质三维分子结构比对

摘要：

为了解决蛋白质三维结构比对需要处理大量的旋转、平移变换,直接用动态规划将变得十分繁琐这一问题,在保留蛋白质空间结构属性特征的基础上,对蛋白质三维数据进行了预先的处理.通过计算蛋白质结构在旋转和平移下的几何不变量,将蛋白质的三维结构坐标变换为具有旋转、平移不变性的一维序列.进一步给出了"距离"以及"相似得分"的定义.在此基础上采用动态规划方法给出了新的蛋白质结构比对算法.对专家分类的蛋白质结构数据库进行测试,结果显示准确、快速.

关键词：蛋白质结构、比对、相似分值、动态规划

所属期刊栏目：53

分类号：TP301.6(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金60474019;河北省自然科学基金F2005000482

在线出版日期：2007-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：37-40