基于数据挖掘的股外侧肌基因表达谱的增龄性变化研究

摘要：

目的:基于数据挖掘的分析方法,研究骨骼肌增龄性的基因表达差异,探讨与老年人肌肉衰减综合症相关的差异基因,分析差异基因富集的重要分子通路,寻找相关分子标记,为后续工作提供可能的研究线索和思路.方法:利用基于高通量平台检测的老年人和年轻人的股外侧肌的基因表达数据,进行差异基因筛选,并利用相关在线数据库和分析工具进行GO和KEGG富集分析,使用STRING在线工具和Cy-toscape软件分析和制作差异基因的蛋白互作网络,寻找相关分子标记.结果:筛选出2028个股外侧肌的增龄性差异表达基因,其中2020个为表达下调基因、8个为表达上调基因.通过基因富集分析,在维生素消化吸收、T细胞受体信号通路、神经营养蛋白信号通路、神经活性配体-受体相互作用、Jak-STAT信号通路、胰岛素抵抗等重要通路均有较多的差异基因的富集.利用蛋白互作网络分析和相关算法得到CXCR5、ADCY8、NPY等核心基因.结论:骨骼肌增龄性变化存在大量的基因表达变化,其中绝大多数为基因表达的下调;差异基因可能通过多条重要的分子通路影响老年人群骨骼肌功能的下降和衰退,调控肌肉衰减综合症的发生与发展;筛选出的核心基因可为后续深入研究肌肉衰减综合症的分子标记物提供线索.

关键词：基因表达、富集分析、蛋白互作网络、肌肉衰减综合症

所属期刊栏目：42

分类号：G80-05(体育理论)

资助基金：上海健康医学院"师资人才百人库"项目A3-0200-21-311007

在线出版日期：2021-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：78-84