基于数据挖掘分析Elafin在肺癌中的表达及意义

摘要：

目的 通过数据库数据分析肺癌中弹性蛋白酶抑制因子(Elafin)的表达及意义.方法 Oncomine数据库分析Elafin基因在肺癌中表达情况并通过实时荧光定量PCR(qPCR)进行验证;Kaplan-Meier数据库分析Elafin表达与肺癌患者预后的关系;Linkedomics数据库分析Elafin基因在TCGA LUAD中的相关基因;通过GSEA tools对Elafin的相关基因进行基因本体论(GO)功能注释、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;string-db数据库构建Elafin蛋白相互作用网络.结果 Oncomine及qPCR结果显示,肺癌组织中Elafin的mRNA表达水平较正常组织显著增高;Kaplan-Meier生存分析显示,Elafin高表达患者总生存期和无病生存期较低表达者明显降低;Linkedomics分析显示Elafin有7697个相关基因;GO分析、KEGG分析显示,Elafin及其相关基因可能与体液免疫反应、粒细胞活化、白细胞介素(IL)-17信号通路、核因子(NF)-κB信号通路等相关;Elafin蛋白相互作用网络显示Elafin与Loricrin角化包膜前体蛋白(LOR)、胱抑素A(CSTA)、丝蛋白(FLG)等相互作用.结论 Elafin在肺癌中表达明显增高且与患者预后相关,是肺癌潜在的诊断与治疗靶标.

关键词：肺肿瘤、弹性蛋白酶抑制因子、数据挖掘、预后

所属期刊栏目：49

分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：湖南省自然科学基金项目;湖南省自然科学杰出青年基金;湖南省临床医疗技术创新引导项目;湖南省卫生计生委科研计划项目

在线出版日期：2021-03-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：169-174