天津地区结核分枝杆菌可变串联重复序列多态性研究

摘要：

目的:分析天津地区流行结核分枝杆菌(MTB)基因组中分布的可变串联重复序列(VNTR)拷贝数目多态性,探讨不同MTB菌株分辨能力强的VNTR基因分型方法.方法:根据VNTR位点PCR扩增产物片段长度分析临床分离的102株MTB菌基因组中22个VNTR位点中重复序列拷贝数目,使用Hunter-Gaston分辨指数(H)评估各个VNTB位点的多态性和VNTR基因分型方法对菌株的综合辨别能力.结果:13个VNTR位点对不同MTB菌株具有较强的分辨能力,其分辨指数达0.9963.其中QUB11b、11a、18、26,MIRU-26、31和Mtub21的多态性较好(H值为0.442～0.699);MIRU-10、27、39、40,QUB1895和ETR-A位点的多态性尚可(H值为0.203～0.316);而MIRU-2、4、16、20、23、24,QUB1451,ETR-B和C的多态性差(H值为0.000～0.150),其中MIRU-2、20、24和QUB1451在北京家族菌株中没有多态性(H=0).结论:选择多态性好的位点组合可以有效地区分不同的MTB北京家族菌株,建立起菌株分辨能力强的VNTR分型方法.

关键词：分枝杆菌、结核、串联重复序列、基因型、多态现象、遗传、流行病学、分子、天津

所属期刊栏目：38

分类号：R74;R71

资助基金：天津市科委应用基础研究资助项目07JCYBJC08800

在线出版日期：2011-02-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：940-943