天津地区风疹病毒的分子特征分析

摘要：

目的:了解2009年天津地区风疹病毒(rubella virus,RV)的分子特征.方法:采用Vero/SLAM细胞培养法分离出10株风疹病毒,用RT-PCR方法扩增10株风疹病毒E1基因编码的1170个核苷酸,并对该PCR产物进行序列测定和分析.分离株与WHO各基因型参考株基于E1基因编码的739个核苷酸构建基因亲缘性关系树.结果:10株风疹病毒与1E基因型代表株处于同一分支,属于1E基因型.核苷酸同源性为97.3%～100%,重要抗原位点未发生变异.血凝抑制和中和位点中,只有Tianjin09-06株在E1蛋白第234位氨基酸发生了变化(Trp234→Ser234).同时所有天津分离的风疹毒株在E1蛋白的第338位氨基酸发生相同突变(Leu338→Phe338),该氨基酸(Phe338)可能是我国1E基因犁风疹病毒所特有.结论:天津地区流行的风疹病毒为E1基因型,在基因亲缘性关系树中形成紧密相连的3簇,处于不同的进化链中,显示天津地区存在不同风疹病毒株的传播链.

关键词：风疹病毒、传染病、逆转录、聚合酶链反应、核苷酸类、基因型、流行病学、分子、天津

所属期刊栏目：38

分类号：R37;R71

资助基金：天津市科技支撑计划重大项目07SYSYSF05100

在线出版日期：2010-09-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：552-555