微小杆菌NOS基因密码子偏好性分析

摘要：

对微小杆菌NOS基因密码子偏好性进行分析,为后续NOS基因的功能验证及遗传转化等研究提供理论依据.研究表明:微小杆菌NOS基因的密码子偏好性较弱,偏好使用G/C结尾的密码子;比较分析不同细菌NOS基因的密码子偏好性参数,发现不同细菌NOS基因密码子偏好性存在一定差异,整体看,放线菌NOS基因密码子偏好性比蓝藻,厚壁菌门强;与其他细菌NOS基因的CDS序列及RSCU值聚类分析表明,微小杆菌NOS基因与放线菌NOS基因表现出相近的密码子使用偏好性;中性绘图、PR2-plot和ENc-plot分析均表明,自然选择是影响NOS基因密码子偏好性形成的主要因素;与 7 种模式生物的基因组密码子使用频率比较发现,在异源转化受体选择中,大肠杆菌原核表达系统较酵母菌真核表达系统更适合微小杆菌NOS异源表达,常见 5 种作物均可作为微小杆菌NOS基因的遗传转化受体,其中水稻更理想.本研究初步揭示了微小杆菌NOS基因密码子使用规律,对后续开展基因功能验证有重要的指导作用,同时也可为生物一氧化氮合成酶进化提供一定科学依据.

关键词：微小杆菌、NOS基因、密码子、偏好性

所属期刊栏目：31

分类号：Q933(微生物学)

资助基金：天津市优秀企业科技特派员项目22YDTPJC00960

在线出版日期：2024-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：23-29