牛ACOT11基因克隆及其编码蛋白生物信息学分析

摘要：

本研究旨在克隆牛ACOT11基因,并对其基因结构和蛋白质结构进行生物学特性分析.以GenBank数据库中公布的人ACOT11基因序列作为探针,检索得到牛的EST序列,进一步设计引物,再利用RT-PCR方法得到cDNA片段序列填补牛EST序列间的空缺,获得牛ACOT11基因.序列分析表明,牛ACOT11基因跨越大约4.9 kb的DNA区域,牛与人ACOT11基因所转录的mRNA同源性为87%.克隆的牛ACOT11基因含有16个外显子和15个内含子,编码区长1 620 bp,编码539个氨基酸.蛋白质结构分析表明,该基因蛋白二级结构预测以α螺旋为主;其35个磷酸化位点分布于丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)残基上;保守结构域预测显示,该基因包含一个START功能结构域;亚细胞定位推测表明,牛ACOT11蛋白分泌通路信号肽所占的比例很小,大部分分布于细胞核内,不属于分泌蛋白.

关键词：牛、ACOT11基因、克隆、生物信息学分析、蛋白质结构

所属期刊栏目：22

分类号：S823(家畜)

资助基金：国家转基因重大专项项目"高产转基因肉牛新品种培育"2014ZX08007-002

在线出版日期：2015-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1-6