10.3969/j.issn.1671-7562.2023.01.005
小细胞肺癌发生和预后相关血清外泌体分子标记物的鉴定和验证
目的:基于血清外泌体数据筛选小细胞肺癌患者核心分子标记物,用于判断小细胞肺癌的发生和预后.方法:从血清外泌体数据库exoRBase中下载健康人群和小细胞肺癌患者基因表达数据集(检索起止:建库至2021年12月10日),采用加权基因共表达网络分析对由118例健康人群和36例小细胞肺癌患者组成的数据集进行分析,通过蛋白-蛋白相互作用以及MOCDE等多种算法筛选核心分子并利用外部ONCOMINE和GEO数据库中多个数据集进行外部验证.结果:基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network,WGCNA)筛选出红色模块与小细胞肺癌发生密切相关,利用蛋白-蛋白相互作用网络等多种算法对模块中基因深入分析,筛选出H2BFS基因作为核心分子.并通过内部数据集验证H2BFS表达与小细胞肺癌发生相关,可以作为有效的血清外泌体分子标记物.同时,外部ONCOMINE证实H2BFS在肺癌中高表达,且在多个GEO数据集(GSE377450、GSE31210和GSE29013)中验证高表达H2BFS患者预后更差.结论:利用血清外泌体数据库并结合WGCNA算法,筛选获得的H2BFS基因可以作为小细胞肺癌患者有效的血清外泌体分子标记物.
小细胞肺癌、血清外泌体、H2BFS、分子标记物
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R734.2(肿瘤学)
2023-04-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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