个体化卵巢癌新抗原的预测和免疫原性验证

摘要：

目的:对卵巢癌组织进行高通量测序,联用生物信息学软件和体外试验验证其免疫原性.方法:采集1例晚期卵巢癌患者外周血和肿瘤标本进行全外显子和全转录组测序,结合PSSMHCpan软件和表位呈现综合预测模型(EPIP)对抗原肽与人类白细胞抗原(HLA)Ⅰ类分子结合的亲和力和表位呈递性预测排序,用筛选出的候选抗原肽分别刺激卵巢癌患者和同HLA型的健康人外周血单个核细胞(PBMC),通过酶联免疫斑点法(Elispot)对免疫反应性进行量化.结果:1.测序结果显示患者具有22个非同义单核昔酸变体、1个插入或缺失.2.根据生物信息学软件,筛选出高亲和力和强呈递性的16条卵巢癌候选抗原肽.3.16条候选抗原肽经体外试验Elispot验证,其中6个基因组成的10条肽具有成为新抗原的潜力,阳性率62.50％.4.同HLA-A*24:02限制的9条候选抗原肽,在同HLA型的健康志愿者与患者中Elispot结果一致.结论:通过物信息学软件明显提高卵巢癌新抗原的验证率,筛选到的OR2G3、SLC19A2、SPTB、C3、ZBED6CL、LY75成为潜在的卵巢癌新抗原.HLA分型相同的健康人外周血可作为验证抗原免疫原性的一种可能的替代方案.

关键词：卵巢癌、新抗原、免疫原性、亲和力、呈递性

所属期刊栏目：50

分类号：R737.31(肿瘤学)

资助基金：湖南省自然基金项目;湖南省第八批创新型省份建设专项

在线出版日期：2022-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：995-1002