FOXI3在头颈部鳞状细胞癌中的表达及相关性分析

摘要：

目的:探究叉头盒I3基因(FOXI3)在头颈部鳞状细胞癌(HNSC)组织中的表达及其对HNSC患者预后的影响,阐明FOXI3在HNSC发生发展中的作用.方法:从肿瘤基因组图谱(TCGA)下载HNSC的基因表达数据和相应的临床信息.使用TIMER 2.0、GEPIA和UALCAN在线数据库验证FOXI3在HNSC中的表达.应用WilCoxon秩和检验分析FOXI3在非配对样本及配对样本中的表达差异.应用R软件ggplot2包分析TCGA数据集中FOXI3表达与HNSC临床因素之间的相关性.应用Cox回归分析TCGA数据库中具有预后信息的HNSC患者,Kaplan Meier数据库及GEPIA数据库验证上述结果.使用R软件进行单因素和多因素Cox分析.使用GeneMania及STRING数据库对FOXI3相互作用基因和蛋白质进行鉴定,同时应用R软件的clusterProfiler包对相互作用的基因进行富集分析.应用TIMER 2.0分析HNSC中FOXI3表达与癌症相关成纤维细胞的浸润水平的相关性.应用R软件GSVA包的ssGSEA算法估计TCGA数据库中HNSC患者FOXI3表达与免疫浸润之间的相关性.结果:FOXI3在HNSC中的表达显著高于正常组织,差异具有统计学意义(P＜0.001).FOXI3基因表达升高的HNSC患者总体生存率(OS)及疾病特异性生存期(DSS)较低表达组差,差异具有统计学意义(P＜0.05).单因素Cox回归显示FOXI3可作为独立的预后因素.GeneMania数据库及STRING数据库显示,与FOXI3相互关联的基因较多,富集分析显示其参与的细胞组分、分子功能、生物学过程及信号通路较复杂.基于MCPCOUNTER、TIDE、EPIC算法,HNSC的FOXI3表达与癌症相关成纤维细胞的浸润水平呈正相关.在HNSC中FOXI3与NK CD56bright细胞浸润水平呈正相关,而与多种免疫细胞的浸润水平呈负相关.结论:FOXI3在HNSC组织中的表达高于正常组织,且其高表达可能与HNSC的发生、发展及不良预后相关,FOXI3可作为HNSC诊断与预后的候选指标.

关键词：头颈部鳞状细胞癌、叉头盒I3基因、生物信息学分析

所属期刊栏目：32

分类号：R730.261(肿瘤学)

在线出版日期：2022-08-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：8-12,后插1-后插4