博来霉素致C57小鼠肺纤维化分子靶点的探寻
目的 探寻博来霉素(BLM)致C57小鼠肺纤维化分子靶点.方法 应用BRB-ArrayTools软件中justRMA算法分析BLM(实验组)和生理盐水(对照组)作用于C57小鼠1、3、14 d后肺组织基因表达谱数据集GSE485,找出差异表达基因;应用DAVID在线工具对这些基因进行功能聚类,结合<京都基因与基因组百科全书>和BioCarta进行生物学通路分析;应用MSigDB搜寻[-2kb,2kb]区域富集的转录因子结合位点.结果 分别筛选出190、345、527个差异表达基因;按功能显著聚集的有趋化因子、膜蛋白、血清蛋白、补体成分、免疫球蛋白、钙黏蛋白、基质金属蛋白酶、前胶原类;受调控的有%11样受体、CCR5、ECM受体、补体途径、TGF-β生物学通路;富集度较高的有API、SRF、NFKAPPAB转录因子.结论 API、SRF和RhoA可能是BLM致C57小鼠肺纤维化的分子靶点.
博来霉素、肺纤维化、差异表达基因、生物学通路、转录因子、小鼠
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R563.902(呼吸系及胸部疾病)
香港保健协会资助项目20050916-2HK
2010-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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