一种基于特征点匹配的生物大分子装配方法

摘要：

研究高分辨率的大分子三维结构,对于分析研究其功能和生物代谢路径具有很重要作用.许多大分子结构可以由低温电镜得到,然而低温电镜三维重构得到的三维结构仍然需要进一步提高其分辨率,所以这些结构仍然需要具体信息.大分子的单独组成部分可以通过结晶、NMR、或者蛋白质结构比较等方法得到.如何将这些高分辨率的组成部分正确装配到大分子结构中是一个很复杂的问题.该问题的实质可以理解为图像处理.在生物大分子的装配过程中,大部分研究者都会用到特征点的方法.现有的研究方法几乎都是基于几何体内的特征点,本文提出一种新的基于蛋白质和低温电镜密度图的表面高斯曲率的方法结合优化模型,对该问题进行研究.数值实验表明,我们的方法是有效的.

关键词：低温电镜、高斯曲率、特征点、生物大分子装配、优化模型

所属期刊栏目：38

分类号：TH1;V55

资助基金：国家重点研究发展计划2016YFC1000307和2016YFB0201304,国家自然科学基金21573274;国家重点研究发展计划子课题2016YFC1000307-10.国家卫生计生委科学技术研究所科技创新基金面上项目2017GJM04

在线出版日期：2017-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：155-166