10.3969/j.issn.1008-0805.2021.10.30
柴胡属植物ITS2序列鉴定与核型似近系数聚类分析
目的 基于ITS2条形码鉴定柴胡属植物及其易混品,对染色体核型参数进行似近系数聚类分析,为柴胡属植物的亲缘关系判定、种质鉴定及物种进化提供依据.方法 收集75份柴胡材料以及在GeneBank数据库中下载29条核糖体DNA第二内部转录间隔区(ITS2)序列.提取柴胡基因组DNA,对其ITS2序列进行PCR扩增并且双向测序,所得序列用CodonCode Aligner软件校对拼接后,利用MEGA X对序列进行分析比对,计算种内、种间遗传距离.利用邻接法(NJ)构建系统聚类树,并应用ITS2数据库网站预测其ITS2二级结构,利用4Sale1.7.1对共有二级结构进行分析;统计整理13种柴胡属植物的核型数据,进行似近系数聚类分析,并计算核型似近系数及遗传距离.结果 75份柴胡材料中,有67条被鉴定为北柴胡,3条被鉴定为黑柴胡,2条被鉴定为藏柴胡,2条被鉴定为三岛柴胡,1条被鉴定为狭叶柴胡.北柴胡的种内最大遗传距离小于种间最小遗传距离,NJ树北柴胡单独聚为一类,具有良好的单系性,ITS2二级结构与NJ树结合可以很好地鉴定柴胡属植物及其混伪品.当核型似近系数接近0.7151时,13种柴胡属植物可以聚类为3大类群.13种柴胡属植物中,线叶柴胡与紫花大叶柴胡核型似近系数最大(0.9955),进化距离最小(0.0045),长白柴胡与锥叶柴胡的核型似近系数最小(0.1476),其进化距离最大(1.9135).结论 基于ITS2条形码技术可以对柴胡属植物进行鉴定,研究柴胡属植物核型似近系数及遗传进化距离,为确保柴胡用药安全,准确鉴定柴胡属植物,规范柴胡人工栽培,以及柴胡属植物的亲缘关系判定等方面提供科学依据.
柴胡;核糖体DNA第二内部转录间隔区(ITS2);核型;进化距离
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R282.12(中药学)
国家重点研发计划2019YFC1710801
2022-01-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
2425-2431
