牛磺酸作用下副溶血弧菌基因转录表达变化分析

摘要：

目的 利用全基因组DNA芯片技术分析牛磺酸作用下副溶血弧菌基因转录变化概况,界定受牛磺酸直接调控的基因,研究其表达调控变化规律.方法 分别采用“牛磺酸持续刺激培养(CTG)”和“中间添加牛磺酸刺激培养(STG)”方案,在副溶血弧菌生长的培养基中添加50 mmol/L牛磺酸,孵育至对数中期OD600=1.2,收集菌体,提取RNA,应用全基因组DNA芯片分别分析比较其和正常对照组的基因转录变化特征,并对比分析两个不同的转录表达谱基因变化特点,界定出可能受牛磺酸直接调控的基因群.同时,应用实时定量逆转录多聚酶联反应对芯片结果进行验证.结果 和对照组相比,CTG实验中,总计有255个基因的转录表达发生显著性变化,上调的基因明显占主导优势；STG实验中,共有129个基因的转录表达发生显著性变化,同样以上调的基因占优势地位.综合分析两个表达谱基因转录表达特征表明,44个基因可能受牛磺酸直接影响调控,分别涉及硫代谢、谷胱氨酸代谢、铁离子代谢、核糖体加工合成等.实时定量逆转录多聚酶联反应结果证实其和芯片数据结果有很强的相关性.结论 我们应用DNA芯片技术描绘出了受牛磺酸影响的副溶血弧菌基因转录表达变化概图,并推测,蛤蜊、扇贝等海洋生物体内含量丰富的牛磺酸资源可能为副溶血弧菌的滋生和繁殖提供了重要保障.

关键词：副溶血弧菌、牛磺酸、芯片、转录调控

所属期刊栏目：22

分类号：R2-03

资助基金：国家自然科学基金面上项目30871370;国家"863"计划课题2006BAK02A15;国家传染病科技攻关计划2009ZX10004-103及2008ZX10004-009

在线出版日期：2012-04-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：2836-2839