头颈部鳞状细胞癌铁死亡相关lncRNA预后模型的建立与验证

摘要：

目的 研究头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)铁死亡相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)并构建相关的HNSCC预后模型.方法 癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获取HNSCC的RNA高通量转录组数据,FerrDb数据库获取和铁死亡相关基因,并基于HNSCC中铁死亡相关差异表达的lncRNA构建HNSCC预后的多lncRNA模型.结果 共获得246个HNSCC铁死亡相关基因和1328个铁死亡相关lncRNA;通过单因素Cox回归分析、LASSO回归及多因数Cox回归分析共筛选得到72个具有独立预后意义的lncRNA构建HNSCC预后模型(均P<0.05).Kaplan-Meier生存曲线显示,高风险组和低风险组的总生存率比较,差异具有统计学意义(P<0.01).1、2和3年受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积分别为0.741、0.739和0.738.结论 通过生物信息学方法筛选出72个影响HNSCC预后的铁死亡相关lncRNA,并成功构建预后风险模型,这72个铁死亡相关的lncRNA可能是HNSCC预后的分子生物标志物和治疗靶点.

关键词：头颈部鳞状细胞癌、铁死亡、长链非编码RNA、预后、生物信息学

所属期刊栏目：37

分类号：R735.2;R687.3;R573

资助基金：北京中医药大学基本科研业务重点攻关项目2020-JYB-ZDGG-129

在线出版日期：2022-12-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：530-542