基于TCGA数据集分析CSTF2基因在肝细胞癌中的表达和临床意义

摘要：

目的 研究裂解刺激因子亚单位2(cleavage stimulation factor subunit 2,CSTF2)基因在肝细胞癌中的表达情况以及其表达与患者临床特征和预后的关系,探究CSTF2基因在肝细胞癌中作用的分子机制.方法 从癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)官方数据库下载肝细胞癌原始RNA测序数据和患者的临床资料,利用R 4.0.2软件提取CSTF2基因表达值,分析其在肝细胞癌组织表达情况,用χ2检验分析CSTF2基因表达与患者临床特征的关系,用Kaplan-Meier法分析CSTF2表达与患者预后的关系,用Cox风险比例模型分析CSTF2的预后价值.基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)用于探究CSTF2基因在肝细胞癌中的分子机制.结果 与癌旁组织比较,肝细胞癌组织中CSTF2表达水平升高(P<0.01),CSTF2高表达组和低表达组患者在TNM分期(P=0.024)和T分期(P=0.008)方面比较,差异均具有统计学意义.CSTF2高表达组患者总体生存率低于低表达组(P<0.01).Cox回归分析显示,CSTF2表达为肝细胞癌患者的独立预后因素(HR=1.107,95％CI:1.045～1.172,P=0.001).GSEA分析结果显示,CSTF2参与基因转录因子、细胞周期、同源重组、DNA降解和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)信号途径等分子机制.结论 CSTF2基因在肝细胞癌中表达上调,并与患者的不良预后相关,为肝细胞癌患者独立预后因素,有望成为肝细胞癌潜在分子标志物.

关键词：肝细胞癌;CSTF2;预后

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在线出版日期：2021-12-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：550-555