胃癌相关癌睾抗原筛选与免疫浸润分析

摘要：

目的 本研究拟在胃癌肿瘤组织和癌旁正常组织差异表达基因中筛选具有免疫功能的癌睾抗原并探讨该类抗原对胃癌生存预后的影响.方法 通过TCGA数据库筛选胃癌肿瘤组织和癌旁正常组织差异表达的基因.同时在CTda-tabase数据库中筛选已有文献证实的能够诱导免疫反应的癌睾抗原.再从差异表达基因中筛选出具有诱导免疫反应功能的癌睾抗原,并结合患者临床信息进行生存分析,将预后相关癌睾抗原进一步利用CIBERSORT进行免疫浸润分析.结果 通过TCGA数据库,共筛选出5514个差异表达基因.CTdatabase中具有诱导免疫反应功能的癌睾抗原有94个,将其与胃癌差异表达基因进行比对,共得到33个具有诱导免疫反应功能的差异表达癌睾抗原.其中27种癌睾抗原在胃癌肿瘤组织中高表达,分别为ARMC3、CDCA1、CEP55、CSAG2、CT45A1、CTAG2、CTCFL、CXorf61(KK-LC-1)、DDX53、IGF2BP3、MAGEA1、MAGEA10、MAGEA12、MAGEA3、MAGEA4、MAGEA6、MAGEC1、MAGEC2、KIF2C、MPHOSPH1、PLAC1、PRAME、SAGE1、SEMG1、SPAG17、SSX1、TTK,且在文献中被证实具有诱导免疫反应的能力.而肿瘤组织中BAGE2、CCDC110、SPAG4、SPAG8、IGSF11、MAGEB2表达低于正常组织.进一步生存分析发现CEP55、MAGEA10、MAGEA12、MAGEA3、MAGEC1、PLAC1高表达与胃癌患者的较短生存显著相关且与肿瘤免疫微环境中具有抗肿瘤能力的M1型巨噬细胞浸润比例呈正相关.多因素Cox回归分析结果提示CEP55与患者较短生存显著相关.结论 本研究从胃癌肿瘤组织高表达的基因中筛选出具有诱导免疫反应功能的癌睾抗原,为胃癌免疫治疗靶点的寻找提供依据.

关键词：胃癌、癌睾抗原、差异表达基因、TCGA、免疫治疗

所属期刊栏目：36

分类号：R735.2(肿瘤学)

在线出版日期：2023-01-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：495-501