子宫珠蛋白与猫主要过敏原Fel d1之间关系的生物信息学分析

摘要：

目的:分析人子宫珠蛋白与猫主要过敏原Fel d 1之间关系.方法:运用ClustalW 1.83和MEGA 5.1 Beta3软件比较人分泌球蛋白家族序列及猫过敏原Fel d 1两个亚基P30438和P30440之间的进化树形图；采用在线软件平台NetMHCII 2.2比较分析P30438与子宫珠蛋白典型序列P11684之间抗原性差异;利用Swiss-Model程序模拟并比较P11684、P30438和P30440的三级结构.结果:分泌球蛋白家族充斥着大量冗余数据,经逐步聚类收缩至13个代表性序列进一步分析发现,整个分泌球蛋白家族划分成两个大家族三个亚家族,而子宫珠蛋白典型序列与猫主要过敏原Feld 1的一个亚基P30438之亲缘关系最近,两者均具有与HLA高亲和力结合位点,而且三级结构相似.结论:子宫珠蛋白具有潜在的过敏原性.

关键词：子宫珠蛋白、猫主要过敏原Fel d 1、进化树形图、抗原性、三级结构

所属期刊栏目：29

分类号：R39;R96

资助基金：国家自然基金30771240;国家科技重大专项重大课题2011ZX08011-005;呼吸疾病国家重点实验室广州医学院课题研究基金

在线出版日期：2013-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：2248-2250