深圳市龙岗区2017年手足口病病原柯萨奇病毒A16型及肠道病毒71型VP1区基因特征分析

摘要：

目的 了解2017年深圳市龙岗区柯萨奇病毒A16型 (coxsackievirus A16, CVA16) 及肠道病毒71型 (enterovirus71, EV71) 的分子特征, 为制定本区手足口病的防控策略提供科学依据.方法 对2017年辖区哨点医院收集的CVA16及EV71核酸阳性样本的病毒VP1区基因进行扩增, 产物回收并测序, 用DNASTAR软件分析不同序列的核苷酸及氨基酸同源性, 应用MEGA 6. 0软件, 以最大似然法 (maximum likelihood method) 构建系统进化树, 进行分子特征分析.结果2017年深圳市龙岗区共报告手足口病13 443例, 发病率为304. 83/10万.测序获得26份EV71及27份CVA16的VP1基因序列, 基因特征分析显示龙岗区EV71序列均属C4a亚型, 可分为3个进化分支.龙岗区CVA16可分为本地流行主分支B1b基因亚型和东南亚流行次分支B1a基因亚型.结论 2017年间, 龙岗区CVA16与EV71病原存在多个进化分支, 需及时对病原的基因型数据进行更新.

关键词：柯萨奇病毒A组16型、肠道病毒71型、系统进化树

所属期刊栏目：26

分类号：R512.5(传染病)

资助基金：深圳市龙岗区医疗卫生科技计划项目 LGK-CYLWS2018000009, 扶持类

在线出版日期：2019-05-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：371-374