云南省四株霍乱弧菌全基因组测序分析

摘要：

目的 选取云南省具有代表性的霍乱弧菌四株,进行了全基因组测序分析,为云南省霍乱弧菌的基因组学研究提供资料. 方法 根据对云南省历年霍乱菌株资料的分析,结合菌株特征和脉冲场凝胶电泳带型特点等,选取了四株代表性霍乱弧菌,采用WGS Illumina HiSeq2500进行paired-end测序.对测序结果进行拼接、组装以及注释等. 结果 基因预测和功能注释结果显示,所有四株霍乱弧菌(YN2011004、YN98296、YN97083和YN89004)均显示携带有2个染色体,同时YN2011004,YN98296和YN89004各自携带有一个质粒.YN2011004的1号染色体具有2727个基因,2号染色体具有958个基因;YN98296 1号染色体具有2 825个基因,2号染色体具有969个基因;YN97083 1号染色体具有1948个基因,2号染色体具有955个基因;YN89004 1号染色体具有2653个基因,2号染色体具有907个基因.所有预测的基因功能主要涉及细菌生理代谢、信号储存和处理以及信号转导等各个方面. 结论 云南省的四株代表性霍乱菌株均具有两个染色体,其中三个菌株还各自含有1个质粒.

关键词：霍乱弧菌、全基因组序列、云南

所属期刊栏目：23

分类号：R378.3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家“十二五”科技重大专项2012ZX10004-212

在线出版日期：2016-07-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：660-663