人巨细胞病毒UL144基因序列分析及T细胞CTL表位预测

摘要：

目的 了解引起新生儿晚期黄疸的人巨细胞病毒(HCMV)UL144基因多态性,预测UL144基因各型编码蛋白的T细胞CTL表位.方法 应用荧光定量PCR法检测晚期黄疽新生儿标本HCMV-DNA含量,采用巢式聚合酶链反应扩增阳性标本HCMV UL144基因开放读码框(ORF),结果进行双向DNA测序,绘制种系进化树对HCMV感染患儿UL144基因进行分型.应用SYFPEITHI和NetCTL方案预测HCMV UL144基因编码蛋白各临床株T细胞CTL表位.结果①30例晚期黄疸新生儿荧光定量PCR检测阳性,其中28例UL144基因扩增阳性.②28株UL144基因与Toledo株进行同源性比较,核苷酸水平为80.4%～99.2%,氨基酸水平为78.9%～98.8%.种系进化树分析显示感染患儿标本UL144基因可分为3个基因型,G1型7株(25%),其中G1a3株,G1b3株,G1c1株,G2型7株(25%),G3型14株(50%),③初步筛选出UL144基因各型T细胞CTL表位:G1a:YTYFSTPGV或HTYFSTPGV;G1b:HTYFSTPGV;G1c:YTSFSISGV;G2:TLCPNGTYL或TLCPNGTYL和HTLFSTPGV;G3:TLCPNGTYV.结论 ①HCMV UL144基因的DNA序列具有高度多态性,晚期黄疸新生儿中HCMV感染以G3型为主.②各型编码蛋白的T细胞CTL表位存在差异.

关键词：人巨细胞病毒、UL144基因、CTL表位

所属期刊栏目：18

分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：湖北省卫生厅科研项目JX3B84

在线出版日期：2011-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：594-597