长沙市2010年手足口病EV71型VP1区基因序列分析

摘要：

目的 了解2010年长沙市手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)重症和普通病例肠道病毒71型(hu-man Enterovirus 71,EV71)VP1区基因特征.方法 收集12例HFMD重症和普通病例的咽拭子或肛拭子标本进行VP1区基因RT-PCR扩增和核苷酸序列测定,测序结果利用sequin软件提交至GenBank,Lasergene和Mega5软件对测序结果进行氨基酸比对分析和构建进化树.结果 12株EV71 VP1区基因序列在进化树上与C基因型中的C4<'a>亚型代表株属同一分支,在核苷酸同源性分析中,12株EV71与C4<'a>亚型代表株(3254-TAI-98)的同源性达到92.6%～93.3%,高于与A、B、C1、C2、C3、CVA16型或亚型代表株的同源性(分别为79.9%～80.7%、83.1%～84.0%、87.9%～88.7%、89.1%～89.8%、87.8%～88.2%和57.3%～58.4%);12株EV71病毒VP1之间的核苷酸有高度的同源性:同源性为98.1%～100.0%,高于与C4亚型代表株的同源性(92.6%～93.3%和91.8%～92.7%).2010年分离自长沙的重症和普通病例与2008年分离自北京、深圳和阜阳的EV71病毒VP1基因序列之间的氨基酸变异位点少.结论 2010年长沙市流行的EV71型病毒属于C基因型中的C4亚型;12例HFMD重症和普通病例的EV71 VP1区基因序列差异较小;不同时间、不同地区和不同病例来源的EV71 VP1区氨基酸变异位点无关联.

关键词：手足口病、肠道病毒71型、VP1、序列分析

所属期刊栏目：18

分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2011-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：420-424