人工锌指核酸酶的电子设计与结构模拟

摘要：

以电子设计用于猪的多位点基因打靶的人工锌指核酸酶为例,探索如何电子设计优化理想的人工锌指核酸酶,以减少人工锌指核酸酶的毒性采用OPEN电子设计方法,生物信息学方法的预测分析ZFP的立体结构,设计优化合适的连接体和间隔体组合,并通过突变优化FokⅠ异源二聚体 采用OPEN法设计三指ZF序列,并连接为ZFP序列,设计出长度为6 bp且富含AT碱基的spacer,加上长度为4个氨基酸残基的inter-domain linker,连接Fok Ⅰ切割结构域双突变子异源二聚体,并通过各种软件工具对ZFN的空间结构进行模拟预测,所设计得到的ZFN的有效率超过50％.探索获得电子设计理想ZFN的方案,即特异性结合DNA的锌指蛋白、最佳的linker和spacer的长度与组合以及优化的特异性切割的FokⅠ异源二聚体切割结构域.

关键词：锌指核酸酶、锌指蛋白、连接体、间隔体、FokⅠ切割域

所属期刊栏目：30

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家科技重大专项项目2009ZX08010-023B;粤港关键领域重点项目2008 A0242000006;广东省科技攻关计划项1目2006B20101012

在线出版日期：2012-03-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：14-18,27