10.16766/j.cnki.issn.1674-4152.003049
肾透明细胞癌核心基因的生物信息学分析及AURKB表达的验证
目的 利用生物信息学手段,在肾透明细胞癌(KIRC)中筛选目标基因AURKB,分析其在肾透明细胞癌中的临床意义.方法 在GEO数据库下载GSE66271数据集后,筛选差异基因.基于STRING数据库和Cytoscape软件挑选hub基因.利用GEPIA在线数据库验证基因AURKB在肾透明细胞癌组织中的表达及预后关系.通过免疫组化实验验证AURKB在肾透明细胞癌组织与癌旁正常组织的表达差异.结果 对数据集GSE66271分析后,共获得517个差异基因,其中155个上调基因,362个下调基因.在差异基因网络中的10个枢纽基因,从中选取基因AURKB进行验证.GEPIA数据库分析显示AURKB高表达均显著降低了 KIRC患者的总生存期(OS)及无病生存期(DFS)(均P<0.001),表示其可能为KIRC的促癌基因.此外AURKB的表达与KIRC患者的不同疾病阶段呈正相关关系(P<0.001).免疫组化实验表明AURKB蛋白表达主要在细胞核内,在癌组织中阳性表达(58.00%,29/50)高于癌旁正常组织(24.00%,12/50),差异有统计学意义(x2=11.947,P=0.001).结论 基因AURKB在肾透明细胞癌中高表达并导致了不良预后,证明其可能为KIRC的一个促癌基因,有望成为KIRC的治疗新靶点.
生物信息学分析、肾透明细胞癌、核心基因、AURKB基因
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R737.11;R730.4(肿瘤学)
安徽省高校自然科学研究重点项目KJ2020A1290
2023-06-29(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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